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病毒解藥如沙裡淘金 超級電腦助藥物定位

加大柏克萊Lawrence Livermore國家實驗室通過計算,推算並公開冠狀病毒3D蛋白結構,再以電腦推算對於SARS冠狀病毒有中和作用的S230抗體如何與新冠狀病毒的表面蛋白互動,圖中S230抗體與冠狀病毒3D蛋白結構凹陷區域(Cavity),相當吻合。

眾創

迄今,新冠病毒尚無正式解藥,新藥從開發以至臨床,需時多月至上年,遠水難救近火。中國開始試用於其他病毒的解藥,以「藥物重新定位」方式,即為經批准的藥物之中,找到對付病毒的特性,以加快治療新冠病毒。

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冠狀病毒科技競賽

英國劍橋MRC Laboratory of Molecular Biology的低溫電子顯微鏡(cryo-EM)FEI Titan Krios,可更為蛋白結構作3D影像。今期《自然》介紹,EMDB蛋白數據庫以cryo-EM成像蛋白結構,突破1萬個,精凖度亦大為提高。不過cryo-EM須動用超級電腦重建3D影像。圖中英國劍橋大學MRC實驗室網上開放大量有關教學資源。

電腦J手記

如果說,新型冠狀病毒有何正面影響,可能是推進快速測試技術。從鑽石公主號傳染速度推測,也許演化成流感般傳染病;據說疫苗開發至少數月,加上動物及人類測試,需時更久,可能數月至上年。 Continue reading “冠狀病毒科技競賽”