醫療創新
近年基因檢測和定序技術進步，成本下降，腸道微生物體（Gut Microbiome）的研究進入了黃金時代，腸道菌提供了治療醫療靶標，處方益生菌續陸出現。
腸道微生態與免疫系統有重要的關係，免疫系統失調導致不少過敏症和慢性病；近年發現腸道微生態與精神健康更關係密切，多項大型研究在各地進行。近期香港一項社區研究發現，益生菌可改善亞健康問題，以腹瀉、便秘、濕疹尤其明顯。
香港腸道微生物組學會公佈一項共招募了超過300人的社區研究的完整結果，收集糞便樣本進行腸道菌群核酸測試（qPCR），再以次世代基因排序技術（NGS Gut Microbiome Test)，研究腸道微生態與亞健康的關係，發現超過六成的慢性病患者有腸道失衡；123位（46.4％）有濕疹及皮膚過敏， 有140位（52.8％）有慢性便秘及142位（53.6％）超重及肥胖，其後參加者根據核酸檢測，補充不同症狀群組所普遍缺乏的標準劑量益生菌。
146位參加者補充益生菌兩個月後，進行了第二次的腸道菌群核酸檢測。數據顯示以上述方法補充益生菌，再評估改善參加者有關過敏濕疹、便秘和腹瀉症狀的評分。結果6成至9成屬於亞健康群組的參加者表示，徵狀分數改善至少達三成以上；其中9成腹瀉患者，平均徵狀分數改善程度超過7成，7成便秘患者平均徵狀分數改善程度，超過4成，6成濕疹患者平均徵狀分數改善程度，則超過3成。
精確醫療對症下藥
參加者補充益生菌前後，不同症狀改善人仕中，特定益生菌相對數量，有不同程度上升。但補充益生菌後的個人腸道菌群核酸檢測，仍存在差異，服用標準劑量益生菌後，三四成人益生菌水平仍處偏低，或可解釋何以存在療效差異。
但研究發現，經2個月補充益生菌，以16S rRNA基因定序技術檢測腸道內菌群的多樣性，濕疹病人腸道微生態α多樣性（Alpha diversity）亦有提高，從以往研究發現人腸道細菌的多樣性卻較低，健康狀況較差，故此α多樣性上升，顯示了健康改善。
香港腸道微生物組學會代表、皮膚科專科醫生盧景勳指出，濕疹患者大多缺乏嗜酸乳桿菌(Lac. Acidophilus)、雙歧桿菌(Bifi. Lactis) 、鼠李糖乳酸桿菌（Lac. Rhamnosus）；而便秘患者大多缺乏植物乳桿菌 (Lac. Plantarum)及嗜酸乳桿菌(Lac. Acidophilus)；慢性腹瀉患者則大多缺乏兩歧雙歧桿菌 (Bifi. Bifidum)、長雙歧桿菌(Bifi. longum)及加氏乳桿菌（Lac. Gasseri）。
盧景勳說，腸道菌群有如人類指紋，獨一無二。以腸道菌群核酸測試後，每人可度身訂做菌株及劑量，對症下藥，療效更佳。益生菌質素亦影響療效，例如益生菌應附帶益生元（Prebiotics），以助益生菌生長，益生菌亦須有足夠的耐胃酸性，才可順利抵達腸道發揮作用。他期望業內有客觀指標，以助消費者選擇。
近期研究發現，腸道菌群與多項精神健康有關，盧景勳說，2021年學會計畫另一項600人大型研究，針對腸道菌群與焦慮症狀／抑鬱、牛皮癬（銀屑病）、睡眠、兒童敏感的關係。
過度活躍菌群失衡
不少研究都發現服用益生菌，有助緩解焦慮和抑鬱情緒，甚至降低皮質醇，有助精神壓力水平降低。
從2011年，香港中大生物醫學學院副院長徐國榮教授研究腸道菌群與疾病關係，國際醫學期刊上發表15篇有關論文，現正研究精神分裂、躁鬱、自閉症等。徐國榮介紹腸道菌群與腦部發育、自閉症、精神科疾病，專注力失調／過度活躍（ADHD）等研究。
原來腸道微生物可加強了血-腦屏障（Blood-brain barrier），腸道菌群阻止了內毒素（Endotoxin），從腸道管壁向血管泄漏，防止其進入循環系統。腸道微生態失調卻破壞了保護，導致血液的內毒素上升，中央神經系統發炎，患者抗壓能力下跌，負面情緒上升。
腸道微生物通過腸道內分泌和代謝物、腸道下免疫系統以及迷走神經（Vagus nerve），從而影響腦部，從多個動物實驗，已獲得了實證。
近年，腸道菌群與自閉症關係有廣泛研究，發現剖腹生產的嬰兒，患自閉風險高至少2成，亦與ADHD病發有關，原因可能由於分娩過程，影響了與母體的菌群反應（Microbiome interactions），導致免疫缺陷，而剖腹和順產嬰兒的腸道菌群，亦往往有明顯差異。
「自閉症患者會避免社交接觸，其中一個理論是源於腸道菌群與大腦的互相影響，腸道通過代謝物（Metabolites ）或迷走神經，改變了大腦處理訊號反應；自閉症患者嗅覺極為敏感，一旦聞到陌生氣味，就會避開接觸建立社交屏障。改善腸道菌群，有可能增強腦部處理訊號能力，重建正常社交。」
ADHD亦與自閉有不少相似之處。ADHD患者往往不能建立「獎賞預期」（Reward Anticipation）；原來非ADHD兒童在期待獎賞，大腦紋狀體區會有激烈反應；ADHD兒童卻不能專注可能會有報酬的預期，行為出現反常。
研究發現，原因也可能是腸道菌群的失調，無法生產足夠多巴胺（Dopamine）和血清素（Serotonin），獎賞預期無法建立。
ADHD患者體內的多巴胺和血清素水平，均較正常為低；加上腸道微生態α多樣性亦低，間接證明了兩者關係。徐教授提出了調理腸道微生態，舒緩抑鬱症及自閉症狀，可能是未來治療手段之一。